於孝天深知瘟疫對他來說的可怕性，經營台灣島，他最擔心的其實並不是西班牙人、荷蘭人、鄭一官和大明官府來找他的麻煩，而是各種各樣的瘟疫。
雖然他很重視搜羅各種名醫，並且培養各種初級的救護兵，甚至於暗中在陸上置辦藥鋪，大規模的暗中儲備收購各種藥材，但是這個時代的醫療水平，還處於很原始的階段，他根本沒有能力來控製一場大規模的瘟疫，更沒有任何現代的藥物來醫治像瘧疾這樣的疫病。
甚至於他連後世最最基本的漂白粉現在都弄不出來，更不要說其它消毒劑了，他目前唯一可用的消毒用品，也就是生石灰了。
所以想要在這個時代避免大規模的瘟疫，他唯有從預防著手，先改造環境，然後注意衛生條件，盡可能的將瘟疫發生的可能性降低，並且控製傳染源頭，從根本做起，這麽做雖然消耗不少人力物力，但是也總比大規模爆發瘟疫之後，再去控製要省的多。
魯有時聽罷之後，趕緊連連稱是，保證一個月之內，把這件事辦好，絕對不敢再懈怠了，說完之後，魯有時不覺間全身驚出了一身冷汗。
“你可以分片包幹，把這些移民村分派給手下的人員負責督查這件事，誰管的地方出問題，你就直接找他說事，誰要是對這件事陽奉陰違，不當成回事，那麽我就請他去苦役營待一段日子，享受享受苦役營的待遇！”
其它那些跟著魯有時過來的負責民務的人員，聽罷之後也都各個毛骨悚然，趕緊跪在地上連連答應，誰都不敢再大意了。
看到這幫家夥已經都被嚇住了，於孝天這才讓他們起來，繼續跟著他巡視移民村，接下來兩天之中，於孝天差不多巡視了一半左右的移民村，而且他選擇移民村巡視，不讓魯有時他們挑選地方，他根據地圖，隨機抽選村落進行巡視。
在巡視之中，於孝天發現了不少問題，都給魯有時他們一一點明，令他們立即記下，分批按時整改。
對於移民村眼下的防禦情況，於孝天也提出了他的意見，淡水城雖然建了起來，但是移民數量越來越多，新建的移民村距離淡水城也越來越遠，所以全憑淡水城的守衛力量，來保護這些移民村的話，很顯然力有不逮。
敵人可能無力攻打淡水城，但是卻可以在其它地方登陸，小股襲擊這一帶的移民村，另外當地土人的問題雖然這半年來有所緩解，但是土人不喜歡他們這些外來者侵占他們的領地，雙方衝突始終存在。
加之海狼不斷增加移民數量，開設新的移民點，建立新移民村，不斷的砍伐掉這一帶的樹林，燒毀灌木，平整土地，開荒種田，也確確實實擠占了原來生活在這一帶的土著部落的生存空間，想要完全和平的和土著部落相處，基本上是不太可能的事情。
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