再到更後麵，民國6 年9 月12 日，臧致平大放光彩，擔任漳汀鎮守使這個職位，這也是他政治生涯極為重要的一步，第二年移駐廈門被提升為福建第二師師長，部隊歸屬皖係李厚基管轄。
民國11 年，他更是因為軍人出身，說話做事爽直，看不得一點齷齪，所以大張旗鼓的反對李厚基、陳炯明聯省自治，無奈被削去師長職務。
一氣之下就投靠同為皖係的蘆永祥。在他的支持下，臧致平信心暴漲，便果斷在11 月7 日晚上發動倒李厚基兵變，果然不出其預料，李厚基兵敗被俘，他也沒把李厚基怎麽樣，隻是把他驅逐出福建了，然後臧致平自任閩軍總司令。
北洋政府看到他兵力強大，便想利用臧致平替他們賣力，立馬以總統黎元洪的名譽任命臧致平為漳廈護軍使，臧致平經過這麽些年也看開了，這個政府就是個軟腳蝦，沒什麽卵用，這個世道，隻有自己強大才是真的強大，便沒有搭理北洋政府 。
民國12 年，北洋政府見臧致平鳥不鳥他們，惱羞成怒，於是便想要打壓臧致平的囂張氣焰，便委任直係孫傳芳去福建署理軍事，也是間接限製臧致平的意思，臧致平自然不願意自己辛苦打下的江山拱手與人，便和王永泉聯名上電京城，擺明車馬告訴北洋政府：福建不歡迎你的人。但是北洋政府沒有搭理，蒼鷹又怎麽會管螞蟻的抗議呢！所以孫傳芳依舊派下來了，但是當孫傳芳抵達南平的時候，臧致平親自去福州和劉冠雄等人商量怎麽阻止他，同調兵北上，聯合王永泉一起抵禦孫傳芳，畢竟孫傳芳不是單槍匹馬來的。
但是王永泉不行，畏畏縮縮，甚至還投靠了孫傳芳，臧致平一氣之下在4 月17 日正式發表通電，反孫獨立。並且4月30 日在廈門召集福建各軍將領舉行聯合討伐孫傳芳的軍事會議。同年5 月，因許崇智被陳炯明麾下的林虎率軍擊敗，臧致平心中無
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