，國防院提議，崇禎帝為馬上皇帝，為了更好地統帥全國的兵馬，加封朱由檢為大元帥。
對於這樣的職務，朱由本來覺得無所謂，但他考慮到，大明軍人的地位肯定會提升，如果士兵將來隻認識自己的將軍，不認識皇帝，將軍們就可能擁兵自重，設立大元帥一職，讓士兵與軍官隨時想到，皇帝、大元帥才是軍隊的最高指揮官，所以也就當朝接受了國防院的加封。
國防院做出解釋，實行軍銜製，並不是給士兵和軍官加薪，前段時間大明進行了北伐和南征，戰爭結束後，對前線的將士除給與物質獎勵外，還根據戰場的表現評定了戰功，但大明使用了新式火器，將士戰死的情況很少，因此，軍官升職一事就異常為難。
比如，一名旅長積累了戰功，按律應該晉升為副師長，甚至是師長，但副師長、師長都在原位，其他軍隊也不缺副師長、師長，便無法安置這位應該晉升的旅長。
以前這種情況很少見，每次大的戰役，大明即使獲勝，也是慘勝，軍官與士兵傷亡都十分慘重，甚至超過失敗的一方，大明基本上是靠人數的優勢在打仗，這樣軍官就會有許多晉升的空缺。
現在的大明，，依靠裝備上的巨大優勢，傷亡的情況很少，因此，建立戰功的軍官士兵難以得到升職，如果不能按律升職，就會削弱將士們為國立功的積極性，國防院這才設立軍銜製。
建立軍銜製，就是讓那些獲得軍功、應該升職的將士，在暫時沒有空缺時，先行提升軍銜，等到有空缺的職務時，再行晉升，這就像文官的“候補製”。
大臣們聽說軍銜製隻是相當於候補製，不用重新發放俸祿，甚至根本不用另外花銀子，內心裏也就沒有多大的反對意見，朱由檢愛折騰就讓他折騰去，最好他將心思全部花在軍隊身上，朝政留給大臣們解決。
況且，他們剛剛封駁了軍人的五等爵位製，朱由檢心裏一定還窩著火，在這無關緊要的問題上，就不要再觸黴頭了。
第二次軍事改革的四項內容，有三項在朝堂獲得通過，還有一項被大臣們初步否決，不過，也沒有完全堵死，朱由檢發現難以通過時，便以“稍後再議”為由，暫時回避了矛盾和衝突。
朝會隨即轉入下一項議題，財政部長畢自嚴，當朝匯報新的土地出售、耕地開發的情況。
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