無論是漢人還是土著，都是比較親近大明。
鄭芝龍要抹去西班牙人曾經統治過的痕跡，他將聖多明戈城依照附近的河流，更名淡水城，聖薩爾瓦多城改用原來的名稱，雞籠，但他認為，‘雞籠’這個名字，太過土氣，難登大雅之堂，遂用了同音字：基隆。
三個陸戰旅通過台灣西海岸加強聯係，相互協作。
為了防止荷蘭人與西班牙人從南洋派出艦隊，前來報複，鄭芝龍將南海艦隊集中到大員港口，同時傳令，滯留在廣州與廈門的南海艦隊餘部，盡快趕到大員，與他匯合。
在清理財產的時候，鄭芝龍發現，聖多明戈城與聖薩爾瓦多合在一起，都比不上一個熱蘭遮城，兩城這僅僅搜出價值五十萬兩的金銀，加上城中的財物和港口商船上的貨物，價值也不過八十萬兩左右。
而熱蘭遮城一座城堡，就搜出價值一百二十萬兩的金銀財物，如果荷蘭東印度公司願意用每人五百兩贖買人質，又有三十萬的收入。
西班牙在台灣的貿易，已經遠遠不如荷蘭，由此可見，雙方在東方的貿易對比。
在京師的時候，朱由檢曾經口授鄭芝龍，讓他在台灣和南洋地區搜集西夷的火器、技術和書籍。
通過與大明的對比，鄭芝龍發現，荷蘭與西班牙的火炮，口徑比大明的略小，射程也近，使用的還是實心彈，他們的的火槍還停留在火銃階段，比大明的燧發槍整整落後了一代，對大明沒有多少借鑒作用。
在海軍的艦船方麵，西班牙在台灣僅有的幾艘艦船，已經被鄭興一怒之下，全部擊沉了，失去了比較的可能，荷蘭的艦船，噸位比大明的廣船小，火炮的數量卻比廣船多，結構上肯定有一些參考的價值，不過鄭芝龍已經為大明找了一位精通造船技術的荷蘭人斯特恩。
斯特恩現在已經去了福州的造船廠，參與大明的艦船射擊，但鄭芝龍還是將俘獲的荷蘭艦船開往福州，必要的時候給斯特恩作為參考。
關於科學方麵的書籍，鄭芝龍倒是搜出幾本，主要是孩子們學習的書籍，他命人在荷蘭人的協助下，翻譯成漢語，為了防止翻譯上的錯誤，鄭芝龍是命令兩套人馬分別翻譯，等完工後一並送至京師，但這個過程時間比較長，不
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