第三組成分占信息總量的17.4%。圖5中，從廣東向西南、西北、東北三個方向延伸出三個不同的結構。這張圖體現的是與第一主成分的擴散不同的百越民族遷徙的過程。廣東等地受到漢族移民衝擊之後，百越原住民開始搬遷，在別處重新定居。
百越長期以來作為南方的主體民族，曾經與許多外係統民族接觸交流，也發生了一定的基因交流。
浙閩地區曾是百越的主要政治中心，所以這一地區現代的漢族群體中保留了相當比例的越族特征遺傳標記。以M119突變比例為例子，上海和浙江都是26%左右，是全國漢族中最高的，其次是廣東20%、安徽18%、遼寧和湖北17%、江蘇16%、江西14%、湖南13%、河南11%、山東9%、四川7%、雲南4%，實際上是以浙江為中心沿海岸線擴散。
南亞先民沿雲貴高原西側北上形成漢藏語係的同時，從中分離出一支南亞先民朝東南方向遷徙，繞過老撾的崇山峻嶺，距今1萬多年前，南方的北部灣形成了澳泰語係祖先。這一支黃種人帶著M119突變從越南和廣西方向進入中國，沿著海岸線往東北走，形成了百越民族。一種古老的澳泰語。這個語係祖先的形成是在2萬多年前南方的北部灣。澳泰語係人群在民族學上又稱為百越民族係統，他們曆史上的覆蓋範圍是從越南北部的交趾分布到江浙一帶。在千百年的分化中，誕生了黎族、侗族、水族、仫佬族、仡佬族、高山族、壯族、傣族。這些民族在語言、文化上有很強的一致性，所以也統稱越人。
在2萬多年前，澳泰語係形成的時候，就有一支部落沿著海岸線往上跑。他們幾乎就沒有留下沿途停滯的痕跡，一直跑到西遼河流域再停留下來。他們是阿爾泰語係的核心。之後那些阿爾泰語係的先民又朝周邊遷徙，往西分化成蒙古、突厥，往東進入朝鮮、日本，向北穿過白令海峽踏上美洲。
M119突變類型中的M110突變亞類型，更具東越特色，但是在一般漢族群體中沒有發現，在上海馬橋原住民中有相當比例。福建的類型不一樣，有8%的西越特有的M88突變，廣東有7%。
百越與外族的交流融合是一個非常複雜的過程，既有百越的成分流向外族，又不斷有外族融入百越，甚至可能有過西部的許多小民族整體性地融入百越族群的事件，
由於廣西西部和雲南居住著百濮民族，湖南北部居住著三苗族群，所以百越最早的擴散方向是空曠無人的東北和正東。這是兩條不同的路線，攜帶了不同的遺傳標記。發生的年代相當早，至少在河姆渡文化之前。向東北遷徙的越人出於北部類群，先進入江西，形成後來的幹越。部分幹越後來西遷，很可能就是今天的侗族(Kam)，侗
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