淪為終身製，後來又稱為世襲製。
後來，帕木竹政權的外戚格氏家族逐漸取得對地方的控製，建立了以日喀則為中心的實質上的政權，藏人稱之為“仁布巴”，大明朝廷也予以認可，嘉慶四十二年（公元1563年），仁布巴的家臣辛廈巴才旦起兵反叛，辛廈巴家族控製了烏斯藏地方政權，首領稱“第斯藏巴汗”。
大明萬曆四十年（公元1613年），繼任者彭措南嘉控製了阿裏地區，這一地區的許多小國都被占領，除古格王朝外，整個烏斯藏基本上為辛夏巴家族所控製。
但辛廈巴家族崇尚噶舉派（白教），極端仇視格魯派（黃教），仇視格魯派給藏傳佛教帶來的革命性大洗牌，因此，常常武力威脅格魯派。
大明萬曆四十五年（公元1618年），彭措南嘉武力占領色拉寺和哲蚌寺，屠殺、驅趕寺中格魯派僧人，破壞廟宇、建築，並隨後正式建立以日喀則為中心的烏斯藏地方政權，成為繼帕木竹巴、仁布巴之後又一世俗的烏斯藏貴族政權，彭措南嘉自稱藏巴汗。
大明天啟元年（公元1621年），丹迥旺波繼任藏巴汗，依然仇視格魯派，達#賴四世去世後，丹迥旺波不讓他轉世，企圖消滅哲蚌寺。
大明崇禎三年（公元1630年），格魯派在蒙古和碩特部的幫助下，企圖收複色拉寺與哲蚌寺，雙方經過激烈的武裝鬥爭，最終丹迥旺波獲勝，但為了防止敵人依據城堡與自己繼續戰鬥，他下令，在他的統治區，除日喀則等十四城外，拆毀所有的大小城堡。
辛廈巴家族武力建立烏斯藏地方政權，統一了烏斯藏，統一了度量衡，促進了烏斯藏地區經濟的發展，但戰爭本身，又使烏斯藏本來就稀缺的人口急劇減少，到沐啟元進軍烏斯藏的時候，整個烏斯藏人口中藏民還不到五十萬。
丹迥旺波毀城後，將人口集中到有限的十四個城堡中，促進了藏人、蒙人和漢人之間的交流與融合，但漢人勤勞簡樸、勤於思考、善於經營的個性，使他們能迅速聚斂財物，這就遭到占人口絕對多數的藏人與蒙人嫉妒與眼紅，這也是烏斯藏、朵甘地區發生針對漢人暴亂的直接導火#索。
但是丹迥旺波的毀城行為，
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