影響卻是最大，格魯派一出現，就立即傳遍藏人區，迅速在藏人心目中最為重要的前後藏居於統治地位。
格魯派有六大名寺，其中在烏斯藏的就有位於拉薩的三大寺和位於日喀則的紮什倫布寺。
拉薩的三大寺包括甘丹寺、哲蚌寺和色拉寺。
甘丹寺位於拉薩城東北的卓旦沃切山，由格魯派創始人宗喀巴所建，是格魯派的祖寺，寺中主持稱“甘丹赤巴”，是唯一由選舉而不是轉世而來的，地位僅次於達#賴與班禪。
哲蚌寺位於拉薩城西部的格培烏孜山，格魯派最有影響的達#賴就是在這裏修行，寺主稱“哲蚌赤巴”，一般由達#賴所兼任，著名的布達拉宮就位於哲蚌寺。
色拉寺位於拉薩城北郊的色拉烏孜山，寺主稱“色拉赤巴”，有時也是由達#賴兼任，色拉寺是培養武僧的基地，進入中原地區的佛教黃派武林高手，多半出自色拉寺。
而紮什倫布寺位於日喀則西郊，是班禪的修行地，當然此時還沒有班禪的封號，“班禪”是大清順治二年（公元1645年）由順治賜封的。
但紮什倫布寺的寺主地位極高，甚至高於甘丹寺的甘丹赤巴，每逢達#賴去世後，尋找轉世靈童、處理政務工作時，他都臨時主政，地位可見一斑。
但由於日喀則地區人口遠遠少於拉薩，經濟收入不如拉薩地區的寺廟，所以班禪在黃教中地位屈居達#賴之後。
讓人覺得不可思議的是，四大教派雖然各有自己的傳統領地，但都在整個藏人區廣建寺廟，因此，格流派的寺廟往往混雜在一起，給各流派的紛爭埋下種子。
烏斯藏是大明土地上少有的政教合一的地區，其宗教糾紛也與地方政權有著千絲萬縷的聯係。
從蒙元開始，統治烏斯藏的首領是來自山南地區桑日縣的帕木竹家族，首領被賜封為“大司徒”，大明建國後，洪武帝賜封為“蘭花王”。
後來政權被當地的朗氏家族繼承，以乃東縣為統治中心，主要活動在前藏地區，也就是拉薩。
隨著帕木竹政權逐漸腐敗，各地方首腦漸漸建立自己的勢力範圍，成尾大不掉之勢，這些地方首腦的職務，
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