整個南琉球群島的陸地上，不管是軍士還是商人，西班牙人已經全部被俘獲，財產一律被沒收，陸地上已經沒有大明正式的敵人了。
鄭芝龍安排陸戰隊的士兵，重點駐守在最大的城堡馬尼拉，另外就是幾座金礦與鐵礦，兵力比較集中，陸戰隊由鄭興統一指揮。
在大海中，西班牙的艦船已經全部被殲，不是沉沒，就是被南海艦隊俘獲，但南洋還有其它國家的艦隊，特別是荷蘭與葡萄牙，他們已經是大明敵人。
所以，鄭芝龍最不放心的還是大海上。
他將艦船交給副司令張煮，在離開之前，鄭芝龍一再叮囑張煮，艦隊不能太過分散，萬一遇上荷蘭、葡萄牙的艦船，可以充分發揮數量上的優勢，另外就是艦船要靠岸，依靠岸炮的保護，防備西夷艦船的偷襲。
“司令，如果土著不聽命令怎麽辦？”鄭興送鄭芝龍上艦的時候，見左右無人，急忙向鄭芝龍求教，第一次統領這麽多的軍隊，又要駐守這麽廣闊的土地，他有些興奮，同時也有些擔心。
“土著？”鄭芝龍做了個殺頭的手勢，沒好氣地教訓道：“你們手中的燧發槍，難道是小孩子的玩具嗎？如果有人敢反抗，那就格殺勿論，西班牙人不足萬人，就能統治整個南琉球群島，你有三萬多士兵，又有漢人的協助，艦隊給你撐腰，還怕治不了土著？”
“司令，土著畢竟不同於西夷。”鄭興似乎沒開竅。
鄭芝龍見鄭興沒有領會自己的精髓，隻好直言相授：“征服別人的土地，如果沒有殺戮，僅僅靠懷柔，是無法長期統治下去的，一定要恩威並施，島上隻有二十萬漢人，而土著達到二百萬，不行殺戮，就無法建立漢人的威望。”
鄭興微微點頭，“司令，我知道了，恩威並重。”
鄭芝龍繼續道：“不僅反對我們的土著要殺，就是消極對抗、陽奉陰違的土著，也要誘到異地屠殺，現在土著沒有國家觀念，也不知道其它地方的訊息，他們就是一盤散沙，你把他們帶到外地殺了，隻要注意消除痕跡，就不會有人知道，盡量將土著人口降到百萬之內。”
“司令，我想我明白了。”鄭興的臉色有些發白，但為了大明，他很快就恢複了海盜的本色。
“知道就好，但要注意隱蔽，就是對漢人士兵，也要盡量封鎖訊息。”
“是，司令。”鄭興站得筆挺，向鄭芝龍敬了個軍禮。
安排了南琉球群島上的防務，鄭芝龍就準備回國了，他命令士兵將繳獲的黃金白銀全部搬到艦船上，再準備全程的淡水和糧食，自己乘著“南海”號，親自去迎接蘇祿國王也哈巴瑪喇。
從馬尼拉到霍洛島，順風的時候，還不到一天的航程，傍晚時分，鄭芝龍的小型艦隊來到霍洛島，停靠在島的北部。
見鄭芝龍親自來接，也哈巴瑪喇十分高興，他在宮中設宴，為鄭芝龍接風，這場宴會，應該是他作為蘇祿素丹的告別宴了。
第二天一早，也哈巴瑪喇帶著他的王妃、王子與朝中的重臣，上了鄭芝龍的艦船，侍衛們抬著十幾個箱子的行李，上了運輸船，看樣子，這位素丹，是不打算回來了，至少短時間內是不打算回來了。
鄭芝龍回到馬尼拉的時候，天色已經完全暗下來，艦隊當晚就在馬尼拉過夜。
天明時分，鄭芝龍上了旗艦“南海”號，李通、也哈巴瑪喇與他的王妃，也是上
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