r> “密部”指四部六續含有之一切密法，即以生、圓二次第為主體的所有密宗之法；“真言”意為心咒或明咒，即以四支加行含有的一切真言誦修。
上師訣理本門
“上師”意為自心或法性；“訣”意為口訣或精華；“理”意為合理或道理、邏輯；總稱為“法性竅訣道理部”，他蘊含著大圓滿心性部、法性部和竅訣部三部。
四門總體法庫：該法雖為四門一體宗旨，但主要以《俱舍論》為主體，為俱舍論部。
九乘次第
九乘次第是雍仲本教的判教方式，簡單介紹本教的九乘次第為：因四乘、果四乘和無上乘。概括為：恰辛（phy gshen）、囊辛（snang gshen）、車辛（vphrul gshen）、什辛（srid gshen）是因四乘；給尼、章鬆、阿嘎、葉辛是果四乘，無上乘為大圓滿。
本教九乘分三類：《南部伏藏九乘》、《中部伏藏九乘》和《北部伏藏九乘》。
《南部伏藏九乘》分恰辛、朗辛、楚辛、什辛，此四乘稱“因四乘”；居士、仙人、阿噶、耶辛“果四乘”；另加“無上大圓滿乘”，共九乘。此九乘是三類中最主要的一類。
《衛部伏藏九乘》是人本尊貴居外、自明辛饒、悲心無畏、雍仲無畏，此四乘為“因教四乘”；事淨行、形俱在、直生持悲心、非常有義、居無上乘為“果密五乘”。共九乘。
《北部伏藏九乘》是明在、自在、謝端，此三乘為“外三乘”；吐駝、西駝、壓駝乘為“仙三乘”拉譯、朗澤、江澤三乘為“密三乘”。共九乘。
在南、北、衛伏藏的三種傳授中，各自的九乘教導稍有差異，但本質為一。
《南部伏藏九乘》分類簡介：
南部伏藏九乘中，恰辛、朗辛、楚辛、什辛四乘，稱“因四乘”；居士、仙人、阿噶、耶辛為“果四乘”；另加“無上大圓滿乘”。
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